Hvad du skal vide
- En FNA-fil er en FASTA-format DNA- og proteinsekvensjusteringsfil.
- Åbn en med Geneious.
- Konverter til FASTA og lignende formater med det samme program.
Denne artikel forklarer, hvad en FNA-fil er, hvordan man åbner en, og hvordan man gemmer en i et andet format som FASTA, GB, VCF, billeder osv.
Hvad er en FNA-fil?
En fil med filtypenavnet FNA er en FASTA-format DNA- og proteinsekvensjusteringsfil, der gemmer DNA-information, der kan bruges af molekylærbiologisoftware.
FNA-filer kan specifikt bruges til at indeholde nukleinsyreinformation, mens andre FASTA-formater indeholder andre DNA-relaterede oplysninger, såsom dem med FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET eller AA filtypenavne.
Disse tekstbaserede FASTA-formater opstod oprindeligt fra en softwarepakke med samme navn, men bruges nu som en standard i DNA- og proteinsekvensjusteringsapplikationer.
FNA henviser også til nogle teknologiske termer, der ikke har noget at gøre med dette filformat, såsom endelig netværksaccept, filnavn/attributforøgelsesfacilitet, Fujitsu-netværksarkitektur og hurtig naboannoncering.
Sådan åbnes en FNA-fil
Åbn en i Windows, macOS og Linux med Geneious (det er gratis i 14 dage). For at gøre dette skal du navigere til File > Import-menuen og vælge at importere filen via Fra filmenupunkt.
Du kan muligvis også åbne en med BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Prøv Notepad++ eller en anden teksteditor, hvis disse ideer ikke virker. Filen kan faktisk være tekstbaseret og enkel at læse, eller du kan finde ud af, at den ikke har noget at gøre med FASTA-formatet, i hvilket tilfælde åbning af filen som et tekstdokument kan afsløre tekst, der identificerer, hvad der blev brugt til at oprette filen eller hvilket format filen er i.
Sådan konverteres en FNA-fil
Vi kan ikke bekræfte dette, da vi ikke har prøvet det, men du burde være i stand til at bruge Geneious til at konvertere filen til mange andre formater, såsom FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV og VCF. Dette kan gøres via programmets File > Export menu.
Det samme program burde også være i stand til at gemme filen til PNG, JPG, EPS eller PDF via File > Gem som billedfil.
Selvom du norm alt ikke bare kan omdøbe en fils udvidelse til noget andet og forvente, at den fungerer på samme måde, kan du omdøbe en. FNA-fil til en. FA-fil, hvis din specifikke DNA-sekventeringssoftware kun vil genkende FA-formatet.
I stedet for at omdøbe filtypenavne, vil du gerne bruge en gratis filkonverter til at konvertere andre filtyper. I tilfældet med FNA og FA filer, sker det bare sådan, at nogle programmer kun åbner filer, der har FA filtypen, i hvilket tilfælde omdøbning af den skulle fungere fint.
Kan du stadig ikke åbne den?
Hvis du efter at have brugt programmerne fra oven stadig ikke kan få din fil til at åbne, vil du måske opdage, at filtypen faktisk ikke læser. FNA, men i stedet noget, der bare ligner.
FNG-filer (Font Navigator Group) ligner f.eks. meget, som om de siger ". FNA", men hvis du ser godt efter, er kun de to første bogstaver ens. Da filtypenavnene er forskellige, er det en indikation af, at de har et andet filformat og højst sandsynligt ikke vil fungere med de samme programmer.
Det samme kunne siges om mange andre filtypenavne som FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) og FND (Windows Saved Search).
Ideen her er bare at sikre, at filtypenavnet læser. FNA. Hvis det gør det, så prøv igen at bruge programmerne fra oven til at åbne eller konvertere det. Hvis du har en anden type fil, skal du undersøge dens udvidelse for at finde ud af, hvilke programmer der er nødvendige for at åbne eller konvertere den.
FAQ
Hvordan åbner du en FNA-fil i Python?
Konverter først FNA-filen til FASTA-format ved hjælp af et tredjepartsprogram såsom Geneious. Derefter kan du downloade Biopython, et sæt frit tilgængelige værktøjer til biologisk beregning til arbejde med bioinformatik. Se endelig Biopython-vejledningen og kogebogen for instruktioner om at arbejde med FASTA-filer.
Hvordan finder jeg mine FNA-producentnumre på en Ancestry-råfil?
Du kan downloade de fleste DNA-data fra Ancestry.com i.txt-format. Det er dog kun kunder, hvis DNA blev analyseret med næste generations sekvensering (NGS), der har mulighed for at downloade en VCF-fil. For at downloade en VCF-fil skal du være DNA-ejer, have DNA-testet ved hjælp af NGS-teknologi og have mindst 350 MB ledig plads på din enhed.
